Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms