Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms