Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms