Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms