Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms