Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms