Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms