Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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H3F3AP84243 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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H3F3AP84243 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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H3F3AP84243 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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H3F3AP84243 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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H3F3AP84243 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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H3F3AP84243 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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