Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG7P83436 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG7P83436 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG7P83436 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG7P83436 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG7P83436 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
COG7P83436 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
COG7P83436 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG7P83436 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG7P83436 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COG7P83436 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG7P83436 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG7P83436 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG7P83436 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG7P83436 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG7P83436 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG7P83436 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG7P83436 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG7P83436 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG7P83436 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG7P83436 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG7P83436 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG7P83436 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG7P83436 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG7P83436 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG7P83436 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms