Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX3P78415 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX3P78415 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX3P78415 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX3P78415 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX3P78415 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX3P78415 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX3P78415 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX3P78415 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX3P78415 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX3P78415 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX3P78415 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX3P78415 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX3P78415 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX3P78415 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX3P78415 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX3P78415 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX3P78415 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX3P78415 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX3P78415 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRX3P78415 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRX3P78415 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRX3P78415 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRX3P78415 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRX3P78415 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRX3P78415 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRX3P78415 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRX3P78415 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRX3P78415 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRX3P78415 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRX3P78415 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRX3P78415 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRX3P78415 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRX3P78415 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms