Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP1P63208 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP1P63208 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms