Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms