Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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