Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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FAM3BP58499 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FAM3BP58499 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FAM3BP58499 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FAM3BP58499 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FAM3BP58499 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FAM3BP58499 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FAM3BP58499 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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