Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV1P50549 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV1P50549 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV1P50549 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV1P50549 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV1P50549 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV1P50549 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV1P50549 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms