Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRE11P49959 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRE11P49959 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms