Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK8P49336 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK8P49336 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK8P49336 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms