Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPZBP47756 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms