Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ARL1P40616 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ARL1P40616 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms