Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms