Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPARGP37231 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PPARGP37231 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PPARGP37231 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PPARGP37231 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPARGP37231 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms