Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms