Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms