Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms