Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKARP32238 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms