Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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HOXD3P31249 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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HOXD3P31249 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXD3P31249 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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