Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms