Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD247P20963 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD247P20963 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD247P20963 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD247P20963 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD247P20963 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD247P20963 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD247P20963 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms