Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms