Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD53P19397 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD53P19397 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms