Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDCP19113 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDCP19113 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HDCP19113 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDCP19113 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDCP19113 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDCP19113 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HDCP19113 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDCP19113 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HDCP19113 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HDCP19113 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDCP19113 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDCP19113 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDCP19113 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDCP19113 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDCP19113 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDCP19113 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDCP19113 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDCP19113 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HDCP19113 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDCP19113 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDCP19113 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HDCP19113 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDCP19113 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDCP19113 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDCP19113 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDCP19113 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDCP19113 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDCP19113 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms