Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms