Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD46P15529 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD46P15529 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms