Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms