Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL2P13500 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL2P13500 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL2P13500 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL2P13500 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL2P13500 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL2P13500 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL2P13500 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL2P13500 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL2P13500 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL2P13500 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL2P13500 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL2P13500 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms