Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GLI4P10075 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GLI4P10075 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GLI4P10075 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms