Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYBBP04839 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYBBP04839 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYBBP04839 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYBBP04839 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYBBP04839 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYBBP04839 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms