Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms