Protein–RNA interactions for Protein: O75899

GABBR2, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR2O75899 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 UCHL3-206ENST00000618773 1050 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABBR2O75899 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms