Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT7O43581 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT7O43581 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT7O43581 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT7O43581 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms