Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms