Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC11O43248 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC11O43248 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms