Protein–RNA interactions for Protein: O15014

ZNF609, Zinc finger protein 609, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF609O15014 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF609O15014 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms