Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms