Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms