Protein–RNA interactions for Protein: D3W0D1

KLRF2, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF2D3W0D1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLRF2D3W0D1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms