Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms