Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms