Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A8MVJ9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A8MVJ9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms