Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms